Ciao,
L'errore in questione è relativo a winsock, non a mysql in sé... stai cercando di utilizzare un socket mentre un processo sulla stessa macchina lo sta già utilizzando. Visto che le precedenti finestre ti funzionavano, molto probabilmente hai esaurito le risorse TCP o comunque raggiunto il limite massimo di connessioni.
Durante il setup di mysql è possibile specificare il massimo numero di connessioni concorrenti (di base sono impostate, mi pare, a 20). Potresti provare a toccare tale parametro dall' Instance Config Wizard... anche se in realtà si dovrebbe riferire a connessioni effettivamente concorrenti (ovvero provenienti da macchine diverse piuttosto che dalla stessa).
Le alternative sono poche... normalmente una sessione php fa una cosa alla volta, l'ottica è quella... cercare di fare una sorta di processing parallelo sulla stessa macchina probabilmente non è una buona idea.
Ciaociao