Si chiama SOM perché si auto-organizza (vedi apprendimento non supervisionato). In pratica impara a reagire in maniera simile a input simili.
Quindi, se vuoi mappare tutti gli input su 2 classi, devi avere una mappa con solo 2 neuroni. Dopo l'addestramento, i vettori di una classe ecciteranno maggiormente un neurone e quelli dell'altra l'altro neurone.