Sì ... ti leggo anche su
http://forum.html.it/forum/showthread.php?s=&postid=13811454#post13811454
ma devi capire che interfacciarsi ad Office, come ti è stato detto, è abbastanza complesso e si fa in un modo ben preciso. Matlab fa con Excel quello che vorresti fare anche tu con il tuo, ma è un programma non una libreria che puoi usare come vuoi.
Devi usare librerie specifiche per Java fatte per lavorare con Office (Excel ed altro) e non sono di facile utilizzo. Non ci sono scorciatoie.