Domanda sbagliata: devi analizzare il software che vuoi usare e vedere quale piattaforma e' supportata meglio.
Generalmente sono equivalenti.
Centos e' piu' conservativo, ma in un'ottica di un server di produzione va piu' che bene: di avere l'ultimissima versione di php, o del web server, non e' un requisito fondamentale, se il sito (o i siti) funziona(no) senza problemi.