Devi partire dal file mdb originale, quello con cui hai creato l'eseguibile a 32 bit, e su una macchina che ha Access a 64 bit creare il nuovo mde/accde.
Le prove che avevo fatto un paio d'anni fa dicevano che quando hai un componente di office a 32 bit non puoi installare il runtime a 64 bit e viceversa.